Як історична спадщина, бібліотека зберігає близько 77 000 друкованих видань XVI–XVIII століть. Більшу частину своїх історичних друкованих видань вона отримала від бібліотек майнцського відділення єзуїтів, розпущеного в 1773 році, та монастиря майнцських картезіанців, закритого в 1781 році.

Іншими важливими монастирськими бібліотеками з Майнца та околиць, книжкові фонди яких після секуляризації перейшли до Старої університетської бібліотеки, є бібліотеки кармелітів, бенедиктинського монастиря Святого Якова, капуцинів, августинців-пустельників та францисканців-обсервантів. Значні залишки бібліотеки Bibliotheca Palatina, серед яких 63 томи Отгайнріха, потрапили до Майнца через єзуїтську філію в Гейдельберзі.

Огляд мовного та змістовного складу старих фондів до 1900 року та їх походження наведено в статті в «Довіднику історичних книжкових фондів Німеччини» (посилання внизу сторінки). У ній вказано, що загальна кількість друкованих видань після інкунабульного періоду до 19 століття включно становить приблизно 125 700 назв.

Для пошуку старих фондів, крім онлайн-каталогу, можна також скористатися історичними каталогами томів у читальній залі. Алфавітний каталог томів також доступний в цифровому вигляді за адресою www.dilibri.de.

Інкунабули міста Майнц з 1962 року зберігаються в музеї Гутенберга, де вони доглядаються та каталогізуються. Запитання щодо інкунабул просимо надсилати до бібліотеки музею Гутенберга:

Тел. +49 6131 12-2562
gutenberg-bibliothekstadt.mainzde

До Наукової міської бібліотеки належить колекція рідкісних видань 16-21 століть, які є особливо рідкісними або цінними з різних точок зору. Рідкісними виданнями можуть бути історичні, наукові та літературні видатні друковані твори – книги, які змінили світ, або видання, що мають історичне та художнє значення. Друковані видання, що мають особливу цінність для Майнца та історії бібліотек Майнца, мають тут своє місце, так само як і екземпляри з індивідуальними особливостями, які роблять «звичайний» друк унікальним. Друковані видання, що були вкладені в рукописні макулатури, без винятку є частиною колекції рідкісних видань, оскільки за певних обставин вони можуть бути важливим матеріалом для досліджень.

Особливості конкретних примірників, такі як екслібриси, записи про власника, примітки про палітурку та придбання або нотатки цензури, становлять основу для дослідження походження, яке документує походження та історію примірника книги і фіксує сліди, залишені попередніми власниками в цих книгах. Хто, коли і де придбав та переплітав ці примірники, як вони переходили від одного попереднього власника до іншого, яке значення їм надавали і як з ними працювали? На ці питання намагається відповісти дослідження походження в бібліотечному контексті, а результати надає для досліджень.

Провенанс та специфіку примірників можна знайти в онлайн-каталозі міської бібліотеки Майнца за допомогою ключового слова «Провенанс / Специфіка примірників [PRV]». Наразі лише частина старого фонду пов'язана з відомостями про provenance, але робота з провенієнції та візуалізації продовжується систематично.