La Biblioteca Científica Municipal de Maguncia conserva como patrimonio histórico un amplio fondo de manuscritos medievales y grabados antiguos. Notables colecciones especiales, como la producción de la editorial infantil Jos. Scholz, la colección de libros ornitológicos de Jakob Moyats o el archivo Peter Cornelius, se han ido ampliando gracias a donaciones y legados, que se han complementado con adquisiciones de antigüedades.

Como centro de investigación vivo, la biblioteca municipal pone a disposición la bibliografía actual para trabajar con sus manuscritos, impresiones históricas, autógrafos, legados y colecciones especiales. Parte de esta bibliografía se encuentra en una zona de libre acceso en la primera planta de la biblioteca (acceso a través del préstamo).