Moguncja nosi miano „miasta nauki” i naprawdę nim jest. Ponad 39 000 studentów kształci się w różnych dyscyplinach na uczelniach wyższych i uniwersytetach w mieście. Już w szkołach promuje się transfer wiedzy teoretycznej do praktyki gospodarczej poprzez różnorodną współpracę z lokalnymi przedsiębiorstwami. 

Badania naukowe mają w Moguncji duże znaczenie: innowacje dzięki badaniom. Naukowcy codziennie pracują nad innowacyjnymi rozwiązaniami w różnych instytucjach Instytutu Maxa Plancka, Instytucie Biologii Molekularnej, Instytucie Fraunhofera lub w ramach innych lokalnych projektów badawczych. Obszary badań obejmują procesy starzenia się, zmiany klimatyczne, a nawet badania nad polimerami.