2006 yılından itibaren, Alman Federal Çevre Vakfı (DBU) tarafından desteklenen “Ekolojik Sur Onarımı” projesinin hayata geçirilmesi ve 2017’den itibaren bu inşaat çalışmasının tüm kale surlarına yayılmasıyla, habitatlarda ve bitki örtüsü yapısında ciddi değişiklikler meydana geldi.

Proje kapsamında yapılan ağaç kesimleri ve özellikle akçaağaçlarda yayılan is kabuğu hastalığı, kaledeki değerli doğal orman benzeri alanların önemli ölçüde azalmasına neden olmuştur. 

Ekolojik işlevleri mümkün olan en kısa sürede güvence altına alabilmek için, kale için bakım ve geliştirme planının güncellenmesi de gerekli hale gelmiştir. Bu plan, koruma altındaki peyzaj bileşeni olan “Hendeği Bölgesi ile Birlikte Kale Yeşil Alanı” ve komşu alanlardaki bitki örtüsünün bakımını ayrıntılı olarak düzenlemektedir. Ayrıca, Mainz'ın eski şehir merkezi ile üst şehri arasında bir bağlantı olarak Citadelle'nin yeni ve genişletilmiş yol sistemini de göstermektedir. 

Plan, örneğin ışığa ihtiyaç duyan bitki türleri ve sıcağa ihtiyaç duyan hayvan türleri için değerli biyotopların geliştirilmesine yönelik önlemleri de formüle etmektedir. Böylece plan, hem insanın hem de doğanın ihtiyaçlarını eşit ölçüde karşılamaktadır.

• Güneş alan duvar ayaklarında çiçekli bordürlerin geliştirilmesi, ağaçlık kenarlarında gölge seven ot ve çim türlerinin yetiştirilmesi, çalı ve ağaçların yeniden dikilmesi ve sarmaşık dikimi gibi önlemler
• güneşli kesimlerde çayır alanlarının oluşturulması ve örneğin tozlu mulle (Verbascum pulverulentum), keçi dilimsi (Himantoglossum hircinium L.) veya cüce yonca (Medicago minima) gibi Kırmızı Liste türlerinin korunması da bunun bir parçasıdır
• Ağ bağlantılarının korunması ve geliştirilmesi, duvarlarda yaşayan hayvan türleri için yedek habitatların oluşturulması, örneğin duvarlara habitat taşlarının yerleştirilmesi, böcekler ve çit kertenkeleleri için yedek habitat olarak kuru duvarların inşası veya yarasalar için giriş deliklerinin açılması, bakım ve geliştirme planının içeriğine dahildir.