Die Abteilung Anwendungsmanagement betreut alle Ämter und Eigenbetriebe der Landeshauptstadt Mainz. Sie ist zuständig für Programme und Endgeräte an den Arbeitsplätzen. Zudem unterstützt sie Kund:innen in Rheinland-Pfalz, die landesweit bereitgestellte Software der KDZ nutzen.